El siglo XXI ha marcado el comienzo de importantes avances en genética y edición del genoma. Desde la finalización del Proyecto Genoma Humano hasta el desarrollo de terapias basadas en CRISPR, la ciencia ha dado saltos en la comprensión y el tratamiento de las enfermedades crónicas a nivel molecular. Estas innovaciones han transformado la forma en que los médicos abordan las enfermedades complejas, pasando de protocolos de tratamiento amplios a una medicina de precisión adaptada a los perfiles genéticos individuales.
La secuenciación de próxima generación (NGS) representa parte de esta transformación. En 2026, las pruebas de NGS ya no se limitan a los centros académicos o a las clínicas de enfermedades raras. Cada vez forman más parte de los diagnósticos rutinarios en oncología, atención prenatal y tratamiento de enfermedades infecciosas. A pesar de su creciente presencia, muchos médicos aún no saben cuándo solicitarlas, cómo interpretar los resultados y cómo superar los obstáculos logísticos y económicos que conllevan.
Este artículo explora cómo la NGS está redefiniendo la toma de decisiones clínicas, las ventajas y los retos que presenta y lo que depara el futuro a esta herramienta diagnóstica.
¿Qué son las pruebas NGS y por qué pedirlas?
La secuenciación de próxima generación (NGS) es una tecnología de alto rendimiento que permite secuenciar rápidamente grandes extensiones de ADN o ARN. A diferencia de la secuenciación Sanger tradicional, que analiza un gen cada vez, la NGS puede secuenciar varios genes -oincluso genomas enteros- simultáneamente. Esta capacidad la hace especialmente valiosa para identificar mutaciones, variaciones en el número de copias y otras alteraciones genéticas que provocan enfermedades.
Las pruebas NGS tienen el potencial de cambiar la gestión, informar sobre el pronóstico o guiar las decisiones de tratamiento. Esto es especialmente cierto en oncología, donde la disponibilidad de terapias dirigidas como el larotrectinib (para tumores sólidos positivos para la fusión NTRK) y el sotorasib (para mutaciones KRAS p.G12C) ha convertido el perfil genómico en una piedra angular de la oncología de precisión.
Según la encuesta de Sermo, varios factores influyen en la decisión de los médicos de solicitar pruebas de NGS. Los más comunes son el claro impacto en las decisiones de tratamiento (27%) y las recomendaciones de directrices o protocolos (19%). El 30% de los encuestados declaró no participar en absoluto en la solicitud de pruebas NGS, lo que pone de manifiesto la desigual adopción de esta tecnología en las distintas especialidades y entornos de práctica.
Las mejores aplicaciones de las pruebas NGS en la práctica
La NGS ha encontrado su lugar en múltiples contextos clínicos, cada uno con consideraciones y beneficios únicos. En respuesta a una encuesta, los miembros de Sermo clasificaron los ámbitos en los que creen que está teniendo un mayor impacto:
Oncología (perfiles tumorales, selección de terapias dirigidas)
La elaboración de perfiles tumorales mediante secuenciación de nueva generación permite a los médicos identificar mutaciones procesables que pueden ser objeto de terapias específicas. Este enfoque ha reconfigurado las estrategias de tratamiento de cánceres como el de pulmón no microcítico, el de próstata y el colorrectal, en los que las alteraciones genéticas dictan la estrategia terapéutica.
En la encuesta de Sermo, el 35% de los médicos declararon que la oncología era el contexto clínico en el que más habitualmente se encontraban o consideraban la posibilidad de realizar pruebas NGS. Un médico generalista considera que es una de las aplicaciones más sencillas. «No hay mucha información sobre el uso de la NGS en la práctica y cuándo es claramente necesaria», escriben. «Creo que es más útil en neoplasias malignas para patrones más predecibles de la enfermedad».
El cambio hacia el diagnóstico molecular en oncología está respaldado por la evolución de las directrices de tratamiento. Organizaciones como la National Comprehensive Cancer Network (NCCN) recomiendan ahora la realización de perfiles genómicos completos para los cánceres avanzados de pulmón no microcítico, próstata, ovario y vías biliares, lo que convierte a la NGS en un componente esencial del diagnóstico.
Enfermedades genéticas raras o no diagnosticadas
Para los pacientes con enfermedades genéticas raras o no diagnosticadas, la NGS puede proporcionar respuestas que antes estaban fuera de su alcance. La secuenciación del exoma completo (WES) y la secuenciación del genoma completo (WGS) permiten a los médicos identificar variantes patogénicas en miles de genes, lo que a menudo conduce a un diagnóstico definitivo tras años de incertidumbre.
El 20% de los médicos de la encuesta de Sermo identificaron las enfermedades genéticas raras o no diagnosticadas como su aplicación más común para considerar la NGS. Un pediatra y miembro de Sermo destacó su importancia: «Las mayores oportunidades de las pruebas NGS en la práctica clínica son la capacidad de identificar la enfermedad de un paciente, a menudo un niño. Como pediatra, reconozco su importancia cuando permite diagnósticos que, con terapias de apoyo adecuadas, pueden cambiar la calidad de vida del paciente.»
Medicina prenatal o reproductiva
La NGS también ha repercutido en la medicina prenatal y reproductiva, ofreciendo pruebas prenatales no invasivas (NIPT) y detección de portadores con alta sensibilidad. Estas pruebas pueden detectar anomalías cromosómicas, trastornos de un solo gen y microdeleciones que, de otro modo, podrían pasar desapercibidas hasta después del nacimiento.
Un médico generalista planteó problemas éticos. «Cada vez se utiliza más, sobre todo en oncología o diagnósticos prenatales, lo que es útil para el tratamiento y la prevención», señalan. «Pero usos como las pruebas comerciales para detectar anomalías sin ningún problema de salud, sólo para saber si se puede desarrollar una enfermedad, parece preocupante por razones éticas y psicológicas».
Farmacogenómica
La farmacogenómica utiliza información genética para predecir cómo responderán los pacientes a los medicamentos. Los paneles de genotipado basados en el ADN pueden identificar variantes en las enzimas que metabolizan los fármacos, ayudando a los médicos a evitar reacciones adversas a los medicamentos y optimizar la eficacia terapéutica.
La farmacogenómica sólo representó el 4% de los votos en la encuesta de Sermo. La adopción ha sido lenta, en parte debido a la limitada cobertura de los seguros y a la falta de herramientas de apoyo a la toma de decisiones clínicas. «Las pruebas pueden ser inasequibles frente a bien accesibles en función del escenario, la ubicación y el seguro», señala un ginecólogo-obstetra en Sermo. Sin embargo, a medida que las historias clínicas electrónicas (HCE) empiecen a integrar datos farmacogenómicos, esta aplicación podría crecer.
Secuenciación de enfermedades infecciosas o patógenos
La NGS se utiliza cada vez más para identificar patógenos en casos de infecciones o brotes inexplicables. La secuenciación metagenómica puede detectar bacterias, virus, hongos y parásitos en una sola prueba, ofreciendo una solución diagnóstica completa cuando fallan los cultivos tradicionales. Sólo el 4% de los encuestados lo señalaron como un uso habitual de la NGS, pero la secuenciación en el punto de atención podría llegar a ser más factible.
4 ventajas clave de las pruebas NGS
Las ventajas de la secuenciación de próxima generación van más allá de su capacidad para detectar variantes genéticas. He aquí cómo la NGS está mejorando la atención al paciente:
Detección más exhaustiva
Las plataformas de biopsia líquida basadas en la NGS se están utilizando en el desarrollo de pruebas de detección precoz de múltiples cánceres (MCED), aunque la utilidad clínica y la integración en las directrices aún están evolucionando. Estas pruebas analizan el ADN tumoral circulante (ADNtc) en muestras de sangre para identificar señales de cáncer en docenas de tipos de tumores. Este enfoque integral aumenta la probabilidad de detección precoz, cuando el tratamiento es más eficaz.
Capacidad de detección precoz
Una de las aplicaciones más prometedoras de la NGS es su capacidad para captar señales de cáncer en las primeras fases, a menudo antes de que aparezcan los síntomas. Las pruebas de biopsia líquida que utilizan la secuenciación de próxima generación pueden detectar niveles bajos de ctADN, con el potencial de permitir una intervención más temprana.
Localización precisa
Además de detectar el cáncer, algunos ensayos basados en la NGS pueden ayudar a predecir el tejido de origen,una característica fundamental para guiar el tratamiento cuando se desconoce el lugar del tumor primario. Esta precisión podría ayudar a los oncólogos a adaptar la terapia al tipo específico de cáncer, mejorando los resultados y reduciendo los tratamientos innecesarios. Sin embargo, actualmente las directrices de la NCCN para el cáncer de origen primario desconocido no recomiendan universalmente la NGS para la localización.
Ventajas operativas
Los resultados de la NGS suelen estar disponibles en dos o tres semanas. No hay exposición a la radiación, las molestias son mínimas y el riesgo para el paciente es mínimo. «La secuenciación de nueva generación (NGS) ha revolucionado el diagnóstico clínico, sobre todo en oncología y gestión de enfermedades hereditarias, al permitir una secuenciación rápida, exhaustiva y cada vez más asequible del genoma», observa un patólogo en Sermo.
En una encuesta de Sermo, el 13% de los médicos afirmaron que la NGS cambia con frecuencia el tratamiento de los pacientes de forma significativa, mientras que el 37% dijo que lo hace ocasionalmente.
Superar las barreras logísticas de las pruebas NGS
A pesar de sus ventajas, las pruebas NGS se enfrentan a importantes obstáculos logísticos que limitan su uso generalizado. Un pediatra de Sermo destaca «el coste, los tiempos de respuesta y la interpretación de variantes inciertas».
Los encuestados por Sermo clasificaron los retos más comunes y las estrategias para abordarlos. He aquí un resumen de cada uno:
Variantes de significado incierto
Un aspecto frustrante de las pruebas NGS es la identificación de variantes de significado incierto (VUS): cambios genéticos que no pueden clasificarse con seguridad como patógenos o benignos. Las VUS pueden complicar la toma de decisiones clínicas, dejando a médicos y pacientes en un estado de incertidumbre.
Para hacer frente a esto, los clínicos pueden recurrir a bases de datos curadas como ClinVar y consultar con asesores genéticos o juntas moleculares de tumores. Con el tiempo, a medida que se acumulan más datos, muchos VUS se reclasifican, por lo que resulta útil la revisión periódica de los resultados.
Capacidad de actuación clínica limitada de los resultados
No todas las variantes genéticas tienen implicaciones terapéuticas. En algunos casos, los resultados de la NGS proporcionan claridad diagnóstica pero no ofrecen opciones de tratamiento procesables. Esto es especialmente frecuente en contextos de enfermedades raras, en los que puede que aún no existan terapias eficaces.
El 17% de los encuestados citaron la escasa procesabilidad clínica como un reto importante. La solución reside en establecer expectativas claras con los pacientes antes de realizar las pruebas y centrar el uso de la NGS en los casos en los que es probable que se produzcan hallazgos procesables.
Denegaciones de seguros o problemas de reembolso
El coste sigue siendo un obstáculo importante para la adopción de la NGS. Aunque el precio de la secuenciación ha bajado drásticamente, la cobertura de los seguros es inconsistente, y algunos tipos de pruebas son denegadas por ciertos planes o requieren una amplia autorización previa.
El 16% de los médicos que participaron en la encuesta de Sermo señalaron los problemas con los seguros como uno de los principales retos. «El uso de los resultados de la NGS forma parte de la nueva actualización de la OMS para las neoplasias hematológicas; sin embargo, la terapia dirigida apenas está disponible en la práctica privada debido a las restricciones de las ayudas médicas, y no es factible en la práctica gubernamental», escribe un patólogo de Sudáfrica.
Para evitar problemas de reembolso, los médicos pueden familiarizarse con las políticas de los pagadores, utilizar correctamente los códigos CPT y documentar exhaustivamente la necesidad médica.
Largos plazos de entrega
El 9% de los médicos citaron el tiempo de respuesta como un obstáculo. Las pruebas NGS pueden tardar semanas en completarse, lo que puede retrasar las decisiones de tratamiento. Para mitigarlo, los médicos pueden solicitar la NGS al principio del proceso de diagnóstico y utilizar paneles de respuesta rápida cuando estén disponibles.
Falta de educación o formación
Muchos médicos se sienten poco preparados para interpretar los resultados de la NGS. El 14% de los encuestados citó la falta de educación o formación como un reto importante. «Hay escasez de conocimientos y especialistas en NGS, y el camino por recorrer está muy abierto», escribe un médico de cuidados intensivos.
La solución: invertir en programas de formación médica continuada (FMC), aprovechar las herramientas de apoyo a la toma de decisiones integradas en las HCE y colaborar con genetistas o patólogos moleculares a la hora de interpretar resultados complejos.
¿Hasta qué punto confían los médicos en la interpretación de los resultados de las pruebas NGS?
Los datos de la encuesta Sermo revelan que la interpretación de los resultados de la NGS sigue siendo una curva de aprendizaje para muchos médicos. Sólo el 9% de los encuestados se siente muy seguro interpretando los resultados de la NGS de forma independiente, mientras que el 26% confía en informes y herramientas de apoyo. Otro 20% se siente medianamente seguro con el apoyo de especialistas o genetistas, y un 10% declara tener poca confianza. Un 34% considerable no interpreta en absoluto los resultados de la NGS.
La NGS sólo alcanzará todo su potencial si los médicos saben cómo utilizarla, opina un neurólogo de Sermo. «La NGS es un paso importante hacia la medicina personalizada, pero su impacto real depende de la eficacia con que traduzcamos los datos genómicos en decisiones clínicas prácticas», escriben.
Un médico generalista compartió un enfoque práctico: «En mi experiencia, debido a los elevados costes asociados, me remito a los protocolos para saber cuándo pedirlo. Interpreto los resultados utilizando guías y una segunda opinión de colegas que trabajan en oncología o genética. Se requiere formación y experiencia para ofrecer los resultados a los pacientes de forma sencilla y fácil de usar.» La conclusión: las herramientas de apoyo pueden ayudar a traducir los complejos datos genómicos en información procesable.
Perspectivas de futuro: Las pruebas NGS en el siglo XXI
Los médicos encuestados en Sermo prevén que el papel de la NGS se amplíe en diversas áreas de la medicina. El 21% de los votantes cree que la NGS se convertirá en estándar de atención en muchas especialidades, mientras que el27% espera que se expanda principalmente en oncología y enfermedades raras. «En oncología, se convertirá en un estándar y representará un avance en los tratamientos», predice un oncólogo radioterapeuta.
Otro 26% cree que la NGS seguirá limitada a indicaciones selectas y un 11% piensa que el crecimiento puede superar la capacidad de los médicos para interpretar los resultados.
2026 puede marcar el comienzo de un movimiento hacia la secuenciación en el punto de atención para las enfermedades infecciosas y los diagnósticos rápidos. Los secuenciadores portátiles se están desplegando en entornos de investigación y brotes, permitiendo la identificación de patógenos en tiempo real y la elaboración de perfiles de resistencia a los antimicrobianos. Este cambio puede mejorar la respuesta a los brotes y los resultados en los pacientes críticos.
Al mismo tiempo, la inteligencia artificial desempeña un papel cada vez más importante en la interpretación de la NGS. Los algoritmos de IA pueden marcar variantes procesables, predecir respuestas a fármacos e identificar nuevas dianas terapéuticas.
Transformar la atención clínica, secuencia a secuencia
En 2026, la NGS podría transformar la medicina de precisión. Las ventajas de la NGS incluyen la detección exhaustiva, el diagnóstico precoz, la localización precisa y las pruebas no invasivas. Sin embargo, siguen existiendo retos, desde la interpretación de variantes de significado incierto hasta la gestión de las denegaciones de los seguros.
Únete a la conversación en Sermo para compartir tus victorias diagnósticas, debatir los límites éticos de la ampliación de la NGS al cribado neonatal y al bienestar rutinario, y conectar con médicos que están dando forma al futuro de la medicina de precisión. En un campo que evoluciona tan rápidamente como la genómica, los mejores conocimientos proceden de la primera línea de la atención clínica.
